Chapter 5: Microbial nutrition
Makroalkuaineita Hiili (C) Happi (O) Vety (H) Typpi (N) Rikki (S) Fosfori (P) Kivennäisaineet Ca2+ Mg2+ Fe2+/3+ K+ Na+
Hivenaineet Mn2+ Zn2+ Co2+ Mb2+ Ni2+ Cu2+
Hiililähteet Autotrofit (CO2) Heterotrofit (hiilihydraateja, rasvoja, …)
Energialähteet fototrofit (valo) kemotrofit (orgaanisten tai epäorgaanisten aineiden hapetus)
Elektroni-/vetylähteet Litotrofit (epäorgaaniset aineet) Organotrofit (orgaaniset aineet)
Typpi-, fosfori- ja rikkilähteet NH3, NO32-, aminohappot, nukleotidit aminohappoja, proteiineja, nukleotideja (DNA), (sokereja, lipidejä). PO43- ATP, nukleotideja (DNA), fosfolipidejä, SO42- kysteiini, metioniini, biotiini, tiamiini
Kasvutekijöitä Aminohappot Nukleotidit (puriinit & pirimidiinit) Vitamiinit
Vitamiineja Biotiini Foolihappo Lipoihappo Tiamiini (B1) Riboflaviini (B2) Niasiini (B3) Pantoteenihappo (B5) Pyridoksiini (B6) Kobalamiini (B12) Karboksylaatio 1-C aineenvaihdunta asyylitransferaasi aldehyditransferaasi FAD, FMN NAD, NADP Koentsyymi A aminohappo aineenvaihdunta
Mikroobeja jotka tekevät vitamiineja Riboflaviini: Clostridium, Candida Koentsyymi A: Brevibacterium Kobalamiini: Streptomyces, Propionibacterium C-vitamiini: Gluconobacter, Corynebacterium D-vitamiini: hiiva
Hiiva sisältä B-vitamineja B-vitamiini lähde ihmisille bakteerille
Mineraalisuolaliemi/agari mikrobien viljelyyn K2HPO4 KH2PO4 Na2HPO4 NaH2PO4 NaCl KCL CaCl2 MgCl2 MgSO4 (NH4)2SO4 NH4NO3 NH4H2PO4 KOH FeCl3 FeSO4 Hivenaineet CuSO4 KI MnSO4 ZnSO4 H3BO3 (NH4)2MoO4 (EDTA) Glukoosi
Mineraalisuolaliemi/agari mikrobien viljelyyn vitamiineja aminoppoja lipidejä …….
Sideroforit
Kompleksinen liemi-/agari alustoja Nutrient broth peptoni (liivate hydrolysaatti) lihauute MacConkey tryptoni (kaseiiniuute) peptoni laktoosi NaCl sappihappoja neutraali punainen kristallivioletti de Man, Rogosa, Sharpe (MRS) peptoni lihauute hiivauute dekstroosi Na-asetaati Tween 80 K2HPO4 (NH4)3 sitraatti MgSO4 MnSO4
Selektiiviset liemet/agarit MacConkey kristallivioletti sappihappoja MRS Na asetaati antibiootteja raskas metalleja erilisia hiilidraateja
differentiaaliset liemet/agarit MacConkey Neutraali punainen Veriagari veri hemolyysi
differentiaaliset liemet/agarit Kaseiinihydrolyysi
differentiaaliset liemet/agarit tärkkelysagari tärkkelys + jodi
membraaneja
Sappihapon efektejä membraanille Koolihappo
Aineensiirto membraanin läpi
Permeabiliteetti Aine Vesi glyseroli tryptofaani glukoosi Kloridi-ioni Kalium-ioni Natrium-ioni Suhteellinen permeabiliteetti 100 0,1 0,01 0,001 0,000001 0,0000001 0,00000001
Diffuusio
Kantajan diffuusio
Diffuusio periplasmassa/ympäristössä konsentraatio sytoplasmassa Aika
Diffuusio ravintoaine konsentraatio periplasmassa/ympäristössä sytoplasmassa Aika ravintoaineen käyttö
Kantajan diffuusio ATP binding cassette transporter (ABC transporterit)
Protonigradientti sytoplasma ympäristö H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+
Asetaatti sytoplasma ympäristö H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H+ H3C-COOH H+ H+ H+ H3C-COO- H+
Ionoforit
Uni-, anti-, symportti
Aktiivinen kuljetus
Fosfoenolpyruvaatti fosfotransferaasisysteemi (PTS) Ryhmänsiirto
AVAINSANAT selektiivinen, differentiaalinen liemi/agari kantajan diffuusio aktiivinen kuljetus ryhmänsiirto PTS aktiivinen kuljetus anti-, sym- & uniport ABC transportterit auto-, heterotroofit kemo-, fototroofit lito-, organotroofit makro-, mikronutrientit kasvutekijät, vitamiinit komplexinen, mineraalisuola liemi/agari