Molekylaarinen laskenta Biolaskenta (Bioinformatiikka) Jussi Parkkinen Joensuun yliopisto.

Slides:



Advertisements
Samankaltaiset esitykset
Dna:n replikaatio eli kahdentuminen.
Advertisements

1 Sektorin nimi. 2 Reading times of magazines NRS Finland 2012.
National Public Health Institute, Finland Mitä on riskinarviointi ? - erilaiset riskinarviointien lähestymistavat Jouni Tuomisto.
T Software project – Final demo / 6 Metrix Workgroup Metrix Helsinki University of Technology Software Business and Engineering Institute.
1 Sektorin nimi. 2 Reading times of magazines NRS Finland 2011.
JYVÄSKYLÄN YLIOPISTO UNIVERSITY OF JYVÄSKYLÄJYVÄSKYLÄN YLIOPISTO UNIVERSITY OF JYVÄSKYLÄ Creating methodologic al tools for wp2-wp4 Workpackage 1 UPDATE.
SoberIT Software Business and Engineering Institute HELSINKI UNIVERSITY OF TECHNOLOGY Kokemuksia väitöskirjan tekemisestä Marjo Kauppinen.
Taajuusriippumattomat antennit
1 Finnish Science in International Comparison: A Bibliometric Analysis Annamaija Lehvo & Anu Nuutinen Academy of Finland.
ANIMALS PERCH, SAIMAA RINGED SEAL AND WHOOPER SWAN By grades 4-5 in the Swedenfinnish school.
Proteiinien matka suusta soluille
ENG Masters, part 2, Citing
Fiksu Opiskelija. Opetusaineisto jätteen synnyn ehkäisystä HSY Jätehuolto. Thoughts about Good Life Collected by Tuovi Kurttio, Pääkaupunkiseudun.
Genetics Dihybrid Crosses.
T. Pasanen / Johdatus bioinformatiikkaan 1 4. DNA tietokannat.
Ohjelmistotekniikka Vaatimustenhallinta Kevät 2002 Päivi Ovaska LTKK/Tite.
Bohemian opinion (1570) Finnish opinion (northern lights (aurora borealis) = ”revontulet” which is ”fires of fox”)
Juha Knuuttila Bioinformatiikka TF00AA
Juha Knuuttila Bioinformatiikka. Käytä hakukenttiä ja hae sisältöinformaatiota oppaista (handbook, guide) tai help linkkien alta Yleisinformaatiota.
By Learning for Integration ry. Immigration issues in Finland: Somalis  Until the 1980s Finland was very much a homogenous society with only a few foreigners.
Toomas Tärk Viron matkailun edistämiskeskus Viro. Avaa aistit yllätyksille.
Vakiintuneet kustantajat ja uudet yrittäjät OA-monografiamaailmassa
Back to upper level Observatory, University of Helsinki ESA space science  X-ray Evolving Universe Spectroscopy Mission (XEUS). Observatory coordinates.
NEGATION AS A MARKER OF PROFICIENCY LEVEL IN L2 FINNISH Maisa Martin CEFLING-project University of Jyväskylä.
CompuCamp kysymystä (daha diskattu). Kysymys 1 – Musiikki Mikä yhtye on kuvassa?
Avoimen tieteen osaajakoulutus Lappeenrannan teknillinen yliopisto, Yliopisto-yritys-rahoittajat tutkimustulosten avoimuuden näkökulmasta TkT.
Euroopan Strategisten Investointien Rahaston info Kokkolassa Neuvotteleva virkamies Jussi Yli-Lahti, TEM Konserniohjaus.
Ajankohtien merkitseminen Fennica / Viola EDTF, MARC 21
Markkinoiden juridinen toimintaympäristö Luento 7
BIOLÄÄKETIETEEN koulutusohjelma
Can I Buy Renova Cream Online
Tips for a good entry Kaisa Sibelius Forum Virium Helsinki
Edustajiston kokous 10/2016 Council meeting 10/2016
Opening: Matti Hyvärinen
Markkinoiden juridinen toimintaympäristö Luento 6
5 4 3 UNIVERSITY EXAM L5 at 4.00 – 8.00 p.m.
YLIOPISTOTENTTI / UNIVERSITY EXAM
YLIOPISTOTENTTI / UNIVERSITY EXAM
Kpl 1-3 SOLU.
Volume 192, Issue 1, Pages (July 2014)
Äänestäjän kuluttajansuoja
Introduction to decision analysis
Risk analysis, risk attitudes
" Opettajan näkemys korkeakoulujen IT-palvelusta "
Filosofia ja kasvatustieteen metodologia.
Probability models and decision analysis
Probability models and decision analysis : introduction
Probability models and decision analysis : introduction
Hierarchical models Biotieteellinen tiedekunta / Henkilön nimi / Esityksen nimi
DIC and BMA in BUGS Biotieteellinen tiedekunta / Henkilön nimi / Esityksen nimi
Probability models and decision analysis
Introduction to decision analysis
Books, Libraries and Open Access Avoimen tutkimuskirjallisuuden edistäminen Helsingin yliopiston kirjastossa Marjo Kuusela Helsinki University Library.
BIBLIOMETRIIKKASEMINAARI 2017
BIOLÄÄKETIETEEN koulutusohjelma
HEI ICI annual reporting 2017: results, feed-back, lessons learned
Interim Report January 1- March 31, 2006
Investointipäätökset Investment Decisions (244)
Kansainväliset sopimukset Luento 9
Kansainväliset sopimukset Luento 4
Lännen Tehtaat Interim Report January 1 – September 30, 2006
DO NOT ENTER the exam hall before you are allowed to.
Taiteilijoiden kanssa työskentely Yhteisöprojekteissa
Alustavaa tietoa – HUOM! Ei sido tilaajaa
DO NOT ENTER the exam hall before you are allowed to.
Sulautuvan opetuksen/oppimisen jatkumo
Kartta tutkimusmenetelmien maastosta
BioRefine and Water – Paving the Way for Bioeconomy
Carbohydrates Proteins Nucleic Acids
Esityksen transkriptio:

Molekylaarinen laskenta Biolaskenta (Bioinformatiikka) Jussi Parkkinen Joensuun yliopisto

Bases of nucleic acids

Structures of base pairs proposed by Watson and Crick

Watson-Crick model of double- helical DNA

Sama peptidi-sekvenssi voi esiintyä eri konformaatioissa Punaisella merkitty VDLLKN vasemmassa proteiinissa  kierteinen ja oikealla  -laskoksessa.

Discovering Patterns in Haplotype Data Lipari, July 24, 2003 Esko Ukkonen University of Helsinki

only recombinations; mutations not shown

Example: founders + recombinants (generated data)

Optimization minimize: number of colors (= founders) minimize: number of fragments or number of cross-overs (= maximize the length of fragments) given an upper bound M for colors, maximize fragment length given a lower bound L for (average) fragment length, minimize colors

Primaaristen ja se- kundaaristen lyso- somien muodostu- minen ja merkitys proteiinien hajo- tuksessa. Golgista kuroutuvat pri- maariset lysosomit jou- tuvat useille eri reiteille. A, eksosytoosi; B ja C, fagosytoosi ja autofago- sytoosi; D, autolyysi (koko solun tuhoutumi- nen)