Digitarium / Riitta Tegelberg Luonnontieteellisten museonäytteiden massadigitointi High performance digitisation of natural history collections Digitarium / Riitta Tegelberg Russian-Finnish Symposium “Horizons of the Euregio Karelia region. Museums 3.0.” 6.2.2014

Taustaa: luonnontieteelliset kokoelmat Suomessa Suomessa on yli 40 luonnontieteellistä museota ja/tai kokoelmaa. Suurin on Suomen luonnontieteellinen museo (Luomus, Helsingin yliopisto) Eläin-, kasvi-, sieni- ja geologisia näytteitä ympäri maailmaa Museot + harrastajat = näytteitä yhteensä n. 25 milj. Näytteistä n. 1 % on kuvattu ja 10-15 % tiedot tietokannoissa

Miksi luonnontieteellisiä näytteitä digitoidaan? ”Ikuistaminen” eli kuvaaminen: osa kokoelmista jo hyvin hauraita Kokoelmanhallinta ja tietojen haku sähköiseksi Digitaalisen aineiston selaaminen Fyysisten näytteiden kuluminen vähenee

Miksi luonnontieteellisiä näytteitä digitoidaan? Tieteellinen työskentely, maailmanlaajuisesti Levinneisyystieto: ympäristömuutokset, suojelutarpeet Lajien tuntemus ja määritys

Digitarium on luonnontieteellisten näytteiden digitointiin erikoistunut palvelukeskus Se toimii Joensuussa, Itä-Suomen yliopistossa, yhteistyössä Luomuksen ja Kansallisen Digitaalisen Kirjaston kanssa Digitointi, digitointimenetelmien kehittämistyö, valistus, koulutus

Digitointi, Digitariumissa Näytteiden kuvantaminen, tuhansia / päivä (high performance = suuri määrä, laadukkaasti) Kuvista näytetietojen siirto tietokantoihin Keräys- ja kokoelmatiedot: mikä laji, kuka keräsi, mistä ja milloin Muuta metadataa: kokoelmatietoja, kuvaustietoja

Tavoitteena suurien näytemäärien digitointi edulliseen yksikköhintaan Digitointimenetelmät perustuvat pitkälti automaatioon ja tarkasti suunniteltuihin tuotantoprosesseihin Henkilökunta on koulutettu museaalisten näytteiden käsittelyyn

Digitointiprosessi Näytteiden kuljetus (ja pakastaminen) Näytteiden merkitseminen yksilöllisellä koodilla

’Gaia’: näytteen koko 3 cm – kymmeniä cm Digitointiprosessi Automatisoidut kuvauslinjastot eri näytetyypeille ’Buggy’: näytteen koko 0,5 mm – 3,5 cm ’Gaia’: näytteen koko 3 cm – kymmeniä cm

Digitointiprosessi Nettisovellus ’DigiWeb’ kuvien selailuun, näytetietojen tallennukseen ja verifiointiin – myös etänä Palvelinjärjestelmä suuren datan (big data) hallintaan Lopuksi kuvien ja muun datan siirto museoiden tietojärjestelmiin

Kehitystyön rahoitus Euroopan sosiaalirahaston rahoitus (ESR): asiantuntijuuden ja osaamisen lisääminen, prosessien ja menetelmien kehittäminen, koulutus ja akateemisen työttömyyden vähentäminen Euroopan kehitysaluerahaston rahoitus (EAKR): välineet, laitteet, tilat, tietojärjestelmä ESR- ja EAKR-rahoitus tähtäävät infrastruktuurin muodostamiseen

Tutkimuksen rahoitus Euroopan komission 7. puiteohjelman rahoitus Biodiversity Virtual e-Laboratory (BioVeL), WP2 European Biodiversity Observation Network (EU BON), WP2 EU tutkimusrahoitus tähtää ns. big datan hyödyntämiseen

Lopuksi esimerkki kaupallisesta toiminnastamme Digitarium kuvansi Oslon yliopiston Luonnonhistorian museon 168 500 herbaarionäytettä. Projekti oli voitettu kilpailutus Euroopan talousalueella Alihankkijayritys DigForsk AS (P-Norja) tallentaa näytetietoja käyttäen Digitariumin ohjelmistoja ja palvelimia ‘Ovelta-ovelle’ palvelu, Oslon museon asiantuntijat osallistuvat datan verifiointiin

Kiitos! www.digitarium.fi