The Virtual Cell Software: solun toiminnan mallintamista Liisa-Ida Sorsa S Solubiosysteemien perusteet
The Virtual Cell Software Kehitetty National Resource for Cell Analysis and Modeling (NRCAM) –keskuksessa käytetään internetissä Java-pohjaisena sovelluksena mahdollistaa biokemiallisen ja elektrofysiologisen datan käsittelyn visuaalisesti
The Virtual Cell Software Mallinnettavan otuksen geometria voidaan määrittää ja visualisoida vapaasti Malliin voidaan suoraan lisätä kullekin otuksen sisäiselle oliolle reaktioita ja muita ominaisuuksia Kotisivu:
Käytännön huomioita tarvitaan Java plug-in 1.4 toimii vain Win95/98/NT/XP –käyttöjärjestelmissä ja IE- ja Netscape- selaimien uusimmissa versioissa käyttö vaatii rekisteröitymisen käyttöliittymä on yksinkertainen käyttää auttaa, jos käytössä oleva kone ei ole museotavaraa mallinnettavan datan on oltava hyvin jäsenneltyä virheilmoitukset eivät ole erityisen selkeitä user guide on kattavauser guide Mallit voivat olla julkisia
Miten kaikki toimii? Lähde:
Käyttöliittymästä: mallin luominen mallinnettava solu luodaan nappeja painamalla Model Workspace: BioModel –mallin luontiin ja sen ajamiseen
Käyttöliittymästä: geometrian muokkaaminen Geometry Editor: Kaikkien solujen ei tarvitse olla pyöreitä jokainen voi käyttää elektronimikroskopia- tuotostaan, esim: originaali segmented GIF-image
Tulokset
Yhteenveto Virtual Cell on pitkälle kehitetty mallinnustyökalu erityistä ohjelmointikokemusta ei tarvita mallinnuksen kohde on tunnettava tarkkaan geometria ei juurikaan aseta rajoituksia empiiristä dataa voidaan testata kehitteillä olevaan matemaattiseen malliin