Geenikirjastot ja -pankit Annariikka Hietala 2a. Mikä on geenikirjasto? Geenikirjasto on esim. bakteeriviljelmään.

Esitys aiheesta: "Geenikirjastot ja -pankit Annariikka Hietala 2a. Mikä on geenikirjasto? Geenikirjasto on esim. bakteeriviljelmään."— Esityksen transkriptio:

1 Geenikirjastot ja -pankit Annariikka Hietala 2a

2 Mikä on geenikirjasto? http://www.hs.fi/ulkomaat/a1352960403893 Geenikirjasto on esim. bakteeriviljelmään siirretty jonkin eliön perimä tai osa sitä. Kirjasto voi koostua eliön koko genomista, joka on pätkitty katkaisuentsyymeillä sattumanvaraisiin palasiin ja liitetty bakteerien plasmideihin. Bakteerit ovat siitä käteviä ”varastoja”, että niiden jakautuessa ne monistavat eli kloonaavat myös niihin varastoidun DNA:n. Näin bakteerit valjastetaan tuottamaan siirrettyä DNA:ta. Geenikirjasto voi olla myös ns. vastin DNA kirjasto, josta on käänteiskopionnin avulla otettu pois proteiineja koodaamattomat osat eli intronit. Geenejä on myös tärkeää saada poimittua bakteeriviljelmien lukuisista pesäkkeistä pois. Tämän vuoksi plasmidissa täytyy olla etsimistä helpottavia osia. Tällaiseksi osaksi sopii esim. plasmidissa valmiiksi oleva antibioottiresistenssin aikaansaava geeni. Geeninsiirto on onnistunut jos bakteerit ovat säilyneet elossa niihin lisätystä antibiootista huolimatta. Tätä antibiootin avulla tehtävää seulontaa suuresta bakteerimäärästä kutsutaan antibioottivalinnaksi http://opetus.tv/biologia/bi5/geenin-siirto-kasviin/

3 Kahdenlaiset kirjastot Geenikirjastoja on kahdenlaisia. On olemassa genomisia geenikirjastoja sekä vastin-DNA-kirjastoja. Genomiset geenikirjastot sisältävät lajin koko DNA:n eli myös geenien ulkopuolinen ja intronien sisältämä DNA sekä geenien säätelyalueet. Vastin-DNA-kirjastoissa lähetti-RNA:sta muokataan käänteiskipioijaentsyymin avulla vastin-DNA, joka liitetään bakteerien plasmideihin. Vastin-DNA-kirjastoissa ei ole säätelyalueita.

4 DNA:n tallentaminen geenikirjastoksi s. 90!

5 Geenipankki Geenipankki on geenikokoelma, jonka avulla säilytetään geneettisiä luonnonvaroja; mahdollisimman edustava kokoelma eliöiden kantamasta perintöaineksesta eli DNA:sta. Geenipankki on siis eläinten, kasvien, sienten tai niiden siementen, itiöiden tai alkioiden kokoelma. Näiden lajien geenejä säilytetään esimerkiksi luonnonsuojelutarkoituksessa tai viljelykasvien ja kotieläinten jalostamista varten. Geenipankkien tarkoituksena on se, että tulevaisuudessa on mahdollista käyttää näitä säilöttyjä DNA:n osia hyväksi esimerkiksi sukupuutonpartaalla. https://www.youtube.com/watch?v=A0uGNffkOyQ

6 Lähteet NETTI: https://portal.mtt.fi/portal/page/portal/www/Tietopaketit/Kasvigeenivarat/Julkaisut/ http://www.solunetti.fi/fi/solubiologia/dna-kirjastot/2/ http://bilsablogi.blogspot.fi/2013/04/geenikirjastot.html https://koppa.jyu.fi/avoimet/terveys/ktey004/3%20luento%20%20-%20%20022007.pdf http://opetus.tv/biologia/bi5/geenin-siirto-kasviin/ https://fi.wikipedia.org/wiki/Geenikirjasto http://www.hs.fi/ulkomaat/a1352960403893 https://fi.wikipedia.org/wiki/Geenipankki KUVAT: https://www.google.fi/search?q=geenikirjasto&source=lnms&tbm=isch&sa=X&ved=0CAgQ_AUo AmoVChMIz824iPf1xwIVIiZyCh1lHAFz&biw=1366&bih=633#imgrc=C-IItHZ-EjtmEM%3A https://www.google.fi/search?q=geenikirjasto&source=lnms&tbm=isch&sa=X&ved=0CAgQ_AUo AmoVChMIz824iPf1xwIVIiZyCh1lHAFz&biw=1366&bih=633#imgrc=C-IItHZ-EjtmEM%3A https://www.google.fi/search?q=geenikirjasto&source=lnms&tbm=isch&sa=X&ved=0CAgQ_AUo AmoVChMIz824iPf1xwIVIiZyCh1lHAFz&biw=1366&bih=633#imgrc=kjXBlQKUDrxeiM%3A https://www.google.fi/search?q=geenikirjasto&source=lnms&tbm=isch&sa=X&ved=0CAgQ_AUo AmoVChMIz824iPf1xwIVIiZyCh1lHAFz&biw=1366&bih=633#imgrc=kjXBlQKUDrxeiM%3A