28.4.2010Marianna Kontulainen1 Fluoresenssitomografian simulointia Loppuraportti.

Esitys aiheesta: "28.4.2010Marianna Kontulainen1 Fluoresenssitomografian simulointia Loppuraportti."— Esityksen transkriptio:

1 28.4.2010Marianna Kontulainen1 Fluoresenssitomografian simulointia Loppuraportti

2 28.4.2010Marianna Kontulainen2 Projektin vaiheet Röntgentomografian simulointi Fluoresenssitomografian simulointi

3 28.4.2010Marianna Kontulainen3 Röntgentomografian simulointi Kuvantamistapahtuman simulointi –Eteenpäin-ongelma –Röntgensäteet  lineaarinen –Radon-muunnos –Tuloksena saadaan sinogrammi

4 28.4.2010Marianna Kontulainen4 Rekonstruoidaan kuva sinogrammista –Filtered back-projection Projisoidaan mitatut profiilit takaisin kuva-alueelle ja summataan Suodatetaan

5 28.4.2010Marianna Kontulainen5

6 28.4.2010Marianna Kontulainen6

7 28.4.2010Marianna Kontulainen7 Fluoresenssitomografian simulointi Kuvantamistapahtuman simulointi –Lähteiden ja sensorien sijoittelu –Fantomin optisten ominaisuuksien määrittely Absorptio- ja sirontakertoimet eri alueille –Ratkaistaan eteenpäin-ongelma FEM- mallinnusta käyttäen –Saadaan kunkin sensorin havaitsemat mittauksarvot (light fluence)

8 28.4.2010Marianna Kontulainen8 Kuvan rekonstruointi –Sisääntulona sensorien mittaustulokset –Tavoitteena ratkaista jokaisen FEM-solmun (kolmion) optiset ominaisuudet eli absorbtio- ja sirontakertoimet –Käänteisongelman ratkaisemiseen käytetään muunneltua Tikhonovin minimointifunktiota (on olemassa muitakin tapoja) –Tulosta voidaan parantaa ottamalla mukaan a priori -tietoa

9 28.4.2010Marianna Kontulainen9 Kuvausjärjestelyt 1

10 28.4.2010Marianna Kontulainen10 Fantomi 1 Taustalle sekä epämuodostumille on kullekin määritelty omat absorbtio- ja sirontakertoimet Voidaan käyttää kokeellisesti mitattuja arvoja eri aineille (hemoglobiini, hapettunut hemoglobiini, vesi)

11 28.4.2010Marianna Kontulainen11 Rekonstruoitu kuva 1

12 28.4.2010Marianna Kontulainen12 Kuvausjärjestelyt 2

13 28.4.2010Marianna Kontulainen13 Fantomi 2

14 28.4.2010Marianna Kontulainen14 Rekonstruoitu kuva 2

15 28.4.2010Marianna Kontulainen15 Käytetyt ohjelmistot Matlab EIDORS –Mahdollisuus 3D-mallinnukseen –Huonosti dokumentoitu NIRFAST –Erinomaisesti dokumentoitu –Graafinen käyttöliittymä

16 28.4.2010Marianna Kontulainen16 Vastoinkäymiset EIDORSin valinta puolessa välissä projektia –Huonon dokumentaation vuoksi simulointia ei saatu toimimaan –Aikaa kului turhaan