Case: Siitepölydatan avaaminen Annika Saarto Aerobiologian yksikkö Turun yliopisto 11.2.2016 ATT-koulutus Tämä teos on lisensoitu Creative Commons Nimeä.

Esitys aiheesta: "Case: Siitepölydatan avaaminen Annika Saarto Aerobiologian yksikkö Turun yliopisto 11.2.2016 ATT-koulutus Tämä teos on lisensoitu Creative Commons Nimeä."— Esityksen transkriptio:

1 Case: Siitepölydatan avaaminen Annika Saarto Aerobiologian yksikkö Turun yliopisto 11.2.2016 ATT-koulutus Tämä teos on lisensoitu Creative Commons Nimeä 4.0 Kansainvälinen -käyttöluvalla. Tarkastele käyttölupaa osoitteessa http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

2 Tästä se alkoi Tutkimushanke 1973 ’Suomen aerobiologian työryhmä’ Ulkoilman siitepöly- ja sieni-itiölaskennat vuodesta 1974 alkaen, allergologian tueksi Siitepölytiedotteet vuodesta 1976 alkaen Helsinki Imatra Turku Kuopio Vaasa Oulu Rova- niemi Utsjoki Kevo 2016 Husö

3 Siitepöly- ja itiötiedon käyttö MACC regional multi-model ensemble simulations of birch pollen dispersion in Europe M SofievM Sofiev ·et al., Atmos. Chem. Phys. 15, 8115-8130, 2015 1. Tiedotus2. Tutkimus Mallinnus First comparison of symptom data with allergen content (Bet v 1 and Phl p 5 measurements) and pollen data from four European regions during 2009–2011 K Bastl et al., Science of the Total Environment 229-235, 2016 Allergologia Ilmastonmuutos Analysis of airborne Betula pollen in Finland; a 31-year perspective E Yli-Panula et al.. Int J Environ Res Public Health 6:1706–23, 2009 Metsätieteet Patterns in airborne pollen and other primary biological aerosol particles (PBAP), and their contribution to aerosol mass and number in a boreal forest. Manninen et al., Boreal Environment Research 19 (suppl. B), 383–405, 2014. Southern pollen sired more seeds than northern pollen in southern seed orchards with northern clones of Pinus sylvestris. P Pulkkinen et al., Scan. J. For. Res. 24, 8-14, 2009.

4 Metadatan kuvaus Dataa on miljoonia rivejä. Taulukko 1. Siitepölydataa on olemassa seuraavilta paikkakunnilta ja vuosilta. Turun keräys on ympärivuotinen, muilla paikkakunnilla (ei Hyytiälä) siitepöly- ja itiökauden mittainen. PaikkakuntaKeräysjaksot Datan tarkkuus sähköisessä muodossa sijainti keskiarvo/vrkkaikki havainnot & keskiarvo/2 h Turku1974 -20121974 -20032004-2012Turun yliopisto, Agora-talo, katto Turku2012-2015 Turun yliopisto, Päärakennus, katto Turku2016- Turun yliopisto, Agora-talo, katto Helsinki1990 -2014 Iho- ja Allergiasairaalan katto, Meilahti Helsinki2014 FMI, Kumpula Helsinki2015- HSY, Pasila Joutseno (Lappeenranta) 2001 Tiuruniemi, korkea 2002-2009 Tiuruniemi, matalampi Imatra2010- Kangasala1992-20071992-20032004-2007Pikonlinnan sairaalan katto (61°30´N, 24°05´E) Tampere2008-2014 TAMK, Teiskontie 33 (61°30'N, 23°49'E) Kuopio1980-1980-20032004-Snellmannia/Melania –rakennukset (62°54'N, 27°38'E) Vaasa1986-92, 1997-1986-92 1997-2003 2004-Useita sijainteja Vaasan kaupungin alueella Oulu1976-1976-20032004-Yliopisto, entisen palynologian laboratorion katto Rovaniemi2002-2002-20032004-Lapin aluesairaalan katto Utsjoki1976-1976-20032004-Kevon tutkimuslaitos, Kestilän katto Sodankylä1982-1991 Geologinen observatorio 2007 Hyytiälä2002-2004 HY, Hyytiälän metsäasema, Hyytiäläntie 124, Juupajoki (N 61°51', E 24°17' Perusdatassa kaikki siitepölysekä kaksi yleistä homeisentä (itiöt) on tunnistettu suku- tai heimotasolle. Lisäksi lyhempijaksoisia ja yksittäisiä tutkimusprojekteja, joissa erilainen otos.

5 Datan synnyn vaiheet Keräys Preparointi Mikroskooppinen laskenta Tulosten tallennus

6 Laskennan tallennus lomakkeille ”raakalukuina” 2 tunnin tarkkuudella

7 … ja kuukausilomakkeelle vuorokausikeskiarvoina

8 Excel -Vuorokausikeskiarvot -Raakadata (2 h tarkkuus) Sähköinen tallennus EANin* datapankki -Vuorokausikeskiarvot -Ei kaikki taksonit -Tutkimuskäyttöön; jokainen maa omistaa oman datansa *European Aeroallergen Network Aerobiologian yksikön oman tietokanta -Access > MySQL -Raakadata, josta voi työstää vuorokausi- tai 2h-lukuja

9 Kyselyjä tullut jo usean vuoden ajan Liiketoimintarajoitukset: siitepölyseurantaa rahoitetaan tiedotuspalveluiden myynnillä Varsinais-Suomen liiton Lounaispaikan yhteydenotto kesällä 2015 Turun yliopiston avoimen datan politiikka Siitepölytiedotuksen 40-vuotisjuhlavuosi 2016 Päätös avata 40 vuotta Turun siitepöly- ja itiödataa Yhteistyössä Varsinais-Suomen Liiton kanssa (Lounaispaikka) Data luovutetaan ”ymppinä” Lounaispaikkaan, joka laittaa sen alustalleen (vrk-keskiarvot) Haastekisa loppuvuonna 2016: esim. uudenlaiset visualisoinnit datasta, datojen yhdistäminen ja/tai jotain muuta Datan avaamisen suunnitelma

10 Hyödyt Tiedotus ja Tutkimus Big data ja erilaiset sovellukset Siitepöly, ilmansaasteet ja katupöly. Siitepölykehät Citizen Science Datanlouhinnan yllätykset?

11 Kiitos!