Orgaanisia molekyyleja Chemsketchillä

Esitys aiheesta: "Orgaanisia molekyyleja Chemsketchillä"— Esityksen transkriptio:

1 Orgaanisia molekyyleja Chemsketchillä
Marja Happonen Helmi Liimatainen

2 Chemsketch Ilmainen kemian piirto ohjelma:
Reaktioyhtälöiden piirtämiseen Molekyylien mallinnus

3 Perustoiminnot Chemsketchillä piirtäminen
Pyyhekumi Lasso ”Siivous”-työkalu 3D mallin tarkastelu 3D optimointi

4 Sivupalkeista löytyy kaikki tarvittavat palikat molekyylien rakentamiseen
Atomit oikealta Valmiit rakenteet vasemmalta

5 Chemsketch: 3D mallinnus
Mallinnus puolelta löytyy eri tapoja esittää molekyyli kolmiulotteisesti Tikkumalli (Rautalankamalli ja tikkumalli) Pallotikkumalli Kalottimalli

6 Molekyylin mallinnus Piirrä molekyyli Siivoa rakenne
Tee rakenteesta kolmiulotteinen Siirry 3D viewerin puolelle Tarkastele molekyyliä erilaisina 3D malleina

7 Sidoskulma Kolmen molekyylissä olevan vierekkäisen atomin määrittämä kulma on sidoskulma Mitkä asiat voisivat vaikuttaa sidoskulmaan? Atomit Sidokset

8 Sidoskulman mittaaminen
Piirrä rakenne, siivoa ja muuta se kolmiulotteiseksi. Mallinna rakenne. Valitse sidoskulman mittaus painamalla Valitse haluamasi atomit klikkaamalla niitä, kun olet valinnut kolme atomia aukeaa sidoskulman kertova ikkuna

9 Erilaisia sidoksia Mitä erilaisia sidoksia orgaanisissa yhdisteissä?
Hiili-hiili sidos (Alkaanit) Kaksoissidos (Alkeenit) Kolmoissidos (Alkyynit) Bentseenirengas (aromaattiset yhdisteet)

10 Sidospituuden mittaus
Tehdään kuten sidoskulman mittaus. Tällä kertaa kuitenkin mallinnus puolelta valitaan sidospituuden mittausta varten

11 KIITOS!